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这一次，明军长江，甚至抵近到了南京城外的燕矶，可以说是自南京沦陷以来，这些年明军距离这座大明王朝的龙兴之地最靠近的一次了。并且于南京上元县境内的朱家嘴焚毁了江西的漕船，实现了对清廷赖以为生的漕运的安全的实际威胁。

然而，他们久侯的西南明军依旧是没有等来。孙可望的篡位野心，刘文秀的拖延提防，内的纷争导致了楸枰三局在永历八年的失败。于这些，张名振和张煌言是一无所知的，他们在被清军重新赶了长江之后，并没有直接返回福建，而是继续驻扎于崇明，是要将这鱼刺到底了。

由于张名振、张煌言三长江，尤其是最后一次与南京已在咫尺之间，哪怕是闽粤的天翻地覆也没有妨碍到清廷因此而受到的震动。

永历九年四月，在定远大将军和硕郑亲王济度率领大军抵达衢州未久，清廷便任命了汉军旗固山额真石廷为镇海将军，统领八旗军驻京以加长江的江防。

与此同时，江巡抚李日芃也重加镇江附近的长江防务，以保障南京和南北漕运畅通：在镇江城外长江中的檀家洲近植木桩，编木筏，环以铁索。在檀家洲相对的长江南北两岸和金山安置大炮。以阻截明军西上，在江南岸自镇江至圌山、北岸自瓜州至三江更筑新堤，造木桥，以便军囦队往来巡逻。更命圌山、瓜州等四营守备，率哨船师更番巡逻防御，以防不测。

诸多布置，无非就是为了防止二张再度杀长江，威胁到南京和运河的安全。而这两，也正是张名振和张煌言三长江以来一度取得的两方面最大的战果。

但是，对此驻扎崇明的明军并没有因此而消停下来。七月初三，长江的吴淞海面风大浪，张名振率舰船七百余号，乘夜于贰更时分突袭吴淞。

时，吴淞停有清廷日用千人、费时五年刚刚造成的二百余支战船，船上“械粮饷毕”。清廷原本计划于七月初五征，借此驱逐崇明的明军，结果还没来得及动手，就先行被明军悉数缴获，未完工者则付之一炬。

随后，明军再度黄浦江，在杨家嘴地方登陆，一直攻到上海县的东沟、铁链一带，威上海县城和松江府城。清军沿江堵御，一时猝不及防，明军旋即退回崇明。

明军在长江沿岸频繁击，清军往往是顾此失彼。这样的局面，一直持续到了苏松提督张天禄因隐瞒兵败被革职逮京听勘，苏松师总兵王璟因防范不利而被参奏罢官，清廷调来了浙江宁波副将梁化凤来署理苏松总兵之职，才算是告一段落。

梁化凤，字翀天，陕西长安人。顺治三年武士。曾从阿济格攻姜镶，因功于顺治八年借补江南芜永营参将，素以能征善战著称。张天禄、王璟已是宿将，但却实在拿明军的优势师没有太大的办法。可是这梁化凤一旦到任，很快就将立足于此已近两载的明军赶了崇明，几乎没有费太大的力气。