屯驻汉中期间，蒋琬反复分析当年诸葛亮北伐功亏一篑的原因，认为兵秦川，路艰险，往来不便，不如沿汉、沔东下，于是大造舟船，准备袭击魏国的魏兴、上庸二郡，不料旧疾复发，未能成行。公元244年，病情加重的蒋琬上书刘禅，将益州刺史之职让与费祎。两年后病逝，获赐谥号为"恭"。

负责司法的大臣不解，对蒋琬说："你没过糊里糊涂的事啊？"

，全由蒋琬负责筹集粮、组织运输、补充兵源。基于蒋琬把后勤工作得有条不紊，诸葛亮经常由衷地对随边的人说：“蒋公琰忠心耿耿，雅量宽和，应该与我一起复兴汉室。"除了在场面上称赞蒋琬，日渐到自质下降的诸葛亮，还在暗地里启奏刘禅："臣如了什么意外，军国大事可以全给蒋琬运畴。"

蒋琬事实已经成为一人之下、万人之上的蜀汉二号人，但他依然保持谦逊作风。东曹掾杨戏格内向，平常不说话，蒋琬与他谈，杨戏有时也会问一句答半句，于是有人说杨戏有蔑视上级的傲慢，应予治罪。蒋琬却说："杨戏答不答，有其理，他若赞同我，非其本意，他若反对我，说明我错了，所以他才默然不语，这反而证明杨戏是个痛快之人。"

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蒋琬说："他说我得不如诸葛丞相，就证明我有糊涂之，这有什么可奇怪的？"

蒋琬存世的作品，多为后人辑集，如《蒋恭侯集》、《丧服要记》、《荐董允表》等。蒋琬

不久杨犯罪狱，大家都以为这次杨必死，但蒋琬持依法办理，没有挟嫌报复杨。

值得补记的是：蒋琬的长蒋斌、次蒋显，在蜀汉被灭那年，随姜维死于军之手。

公元238年，乘着曹魏太尉司懿率军忙于讨伐反叛的辽东军阀公孙渊之际，刘禅诏令蒋琬率兵驻汉中，等待时机，联合东吴夹击魏国。为时六年的屯驻期间，蒋琬多次命令姜维采取攻魏态势，虽然收效不大，但也扼止了魏军来犯。

公元234年，诸葛亮病逝五丈原。刘禅遵照诸葛亮早先的密奏，任命蒋琬为尚书令，不久又加行都护、假节，领益州刺史，再升为大将军、录尚书事，封安亭侯。

时下四川省成都市内的武侯祠中的西廊文臣廊中，蒋琬塑像排于第九。蒋琬之墓则在四川省绵市郊西山，由长方形条石砌成，呈八角形。墓一侧，建有蒋恭侯祠，祠前立有神情端庄的蒋琬铜像。祠的大门两边写有"小心自可襄诸葛，大度尤能恕二杨"之联，两句十四个字，现并赞赏了蒋琬的德情。

相比于杨戏的沉默，督农杨对待蒋琬的态度，就犀利得带有攻击质了。杨说："蒋琬事糊里糊涂，工作平大不如从前的诸葛丞相。"有人认为杨涉嫌诽谤，建议蒋琬严惩，以儆效尤。蒋琬笑："我确实不如前任领导，所以杨说得对。"